A klóramin és a klórdioxid hatékonyan használható baktérium, gomba és élesztőgomba ellen. A klórdioxid azonban hatásosabbnak és hatékonyabbnak tűnik az alga, patogének, vírusok, spórák és a biofilm ellen. A biofilm elleni harc és annak elpusztítása alapvető fontosságú a legionella betegség kockázatának minimalizálásában, mint ahogy azt egyes hatóságok megkövetelik, kiváltképp hűtőrendszerek esetén, valamint hideg és meleg vizű rendszereknél. A biofilm elleni védelem minimalizálhatja továbbá a mikrobiológiailag előidézett korrózió (MIC) kialakulásának lehetőségét. Mind a klóramin és a klórdioxid használható a biofilm ellen, a klórdioxid lévén a hatékonyabb. A klórdioxid képes eltávolítani a biofilmet a felületekről is.
